Aantal berichten : 92 Woonplaats : oostende Registration date : 30-09-08
Onderwerp: sequentiedatabanken wo dec 31, 2008 8:55 am
ik ben bezig met de voorbeeldvragen zal morgen in loop van de dag posten watik gevonden heb voel je vrij om vragen die ik niet heb aan te vullen
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 1:37 am
Mr. V schreef:
ik ben bezig met de voorbeeldvragen zal morgen in loop van de dag posten watik gevonden heb voel je vrij om vragen die ik niet heb aan te vullen
Ondertussen al een paar dagen verder mo nog gn vragen gezien Mr. V Zou je ze willen posten of doorsturen aub...
THX
Mr. V 2de jaar BIT
Aantal berichten : 92 Woonplaats : oostende Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 4:42 am
wegens een kater die ergens donderdag opgedoken is heb ik een lichte achterstand op mijn planning... ik zal ze asap 'verder' maken morgen of vandaag komen ze nog op het forum
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 6:31 am
gg vinnie
Lamylar 2de jaar BIT+ admin
Aantal berichten : 143 Leeftijd : 34 Woonplaats : Gistel Registration date : 24-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 6:40 am
Mr. V schreef:
wegens een kater die ergens donderdag opgedoken is heb ik een lichte achterstand op mijn planning... ik zal ze asap 'verder' maken morgen of vandaag komen ze nog op het forum
kater
onean 2de jaar BIT
Aantal berichten : 95 Leeftijd : 36 Woonplaats : lol Registration date : 24-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 8:52 am
Mr. V schreef:
wegens een kater die ergens donderdag opgedoken is heb ik een lichte achterstand op mijn planning... ik zal ze asap 'verder' maken morgen of vandaag komen ze nog op het forum
waarom zou je achter staan op je planning door een nieuwe kat?
Mr. V 2de jaar BIT
Aantal berichten : 92 Woonplaats : oostende Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken di jan 06, 2009 10:26 am
net gedaan met ctt zijn vak ben nu bezig aan dumon wss is dumon tegen de middag af ton vlieg ik erin voor dien oefeningen... sry voor de delay blame evil kitty and ze minions!
Mr. V 2de jaar BIT
Aantal berichten : 92 Woonplaats : oostende Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken wo jan 07, 2009 10:59 am
Mr. V has tried and failed.... nuja swoit ik hoop op wat aanvulling en feedback anders CBA tis veel te moeilijk om dingen waarwe 10min naartoe gekeken hebben in de les om perfect te kunnnen... gelijk sequentie allieneren volgens de regels van god weet wie... zowiezo dit is wat ik vond
Code:
1)sequentie-homologie: ik veronderstel dat ze hiermee bedoelen dat ze uit dezelfde ouder gen komen en sequentie-similariteit: sequentie die lijkt op een andere maar niet van zelfde ouder gen... 2)Twee genen zijn paraloog aan elkaar, als ze ten eerste homoloog ten opzicht van elkaar zijn en ten tweede beide deel uit maken van het zelfde organisme. Zijn de twee genen homologen, maar behoren ze elk tot een ander organisme, dan spreekt men van orthologen. 3) ik veronderstel omdat het de het teneerste allineerd over heel de sequentie en zo zijn we alle gelijke elementen zien (bij proteinen AZ, bij dna basen enzovoort..) 4)Local alignment: find best partial alignment of two sequences en Global alignment: align full length of both sequences. Amino acids are NOT distributed evenly Amino acids share similarity based on chemical and physical properties 5)omdat het visueel is??? 6)wait wut 7)staat ergens in les 5 8)zie bovenstaande 9)ik denk mogenlijkheid tot homologie of een SNP? 10)ik ga eerlijk zijn en gok op D, nuja is het meest logische aangezien anders teveel kans op mutaties..
bram 2de jaar BIT
Aantal berichten : 16 Woonplaats : Lendelede Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 12:52 am
Van die vraag 10, op wikipedia staat er 1 op ~1000. Dusja, dan is C het dichtst daarbij...
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 3:59 am
Vraag 10 is zeker C gg Brams
Iemand oefeningen 22 tot einde gemaakt??? Is lijk onmogelijk
morf 2de jaar BIT
Aantal berichten : 95 Leeftijd : 35 Woonplaats : Zwevegem Registration date : 26-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 4:18 am
De geheime boodschap van juresic park is 'MARK WAS HERE NIH'
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 6:30 am
morf schreef:
De geheime boodschap van juresic park is 'MARK WAS HERE NIH'
enige verduidelijking van hoe je hieraan komt???
meisj 2de jaar BIT
Aantal berichten : 11 Leeftijd : 35 Woonplaats : Staden Registration date : 24-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 6:52 am
Djespur schreef:
morf schreef:
De geheime boodschap van juresic park is 'MARK WAS HERE NIH'
enige verduidelijking van hoe je hieraan komt???
Je voegt die in op BLASTALL (http://www.ebi.ac.uk/Tools/blastall/index.html) Dan kies je voor BLASTX. Dan BLAST result Dan zie je in de gaps, mark was here nih
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 7:53 am
meisj schreef:
Djespur schreef:
morf schreef:
De geheime boodschap van juresic park is 'MARK WAS HERE NIH'
enige verduidelijking van hoe je hieraan komt???
Je voegt die in op BLASTALL (http://www.ebi.ac.uk/Tools/blastall/index.html) Dan kies je voor BLASTX. Dan BLAST result Dan zie je in de gaps, mark was here nih
THX
morf 2de jaar BIT
Aantal berichten : 95 Leeftijd : 35 Woonplaats : Zwevegem Registration date : 26-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 8:16 am
jasper toch ...
Djespur 2de jaar BIT
Aantal berichten : 68 Leeftijd : 36 Woonplaats : Brugge Registration date : 25-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 8:51 am
morf schreef:
jasper toch ...
had van internet de verkeerde sequentie gehaald
JurassicPark Dino DNA ipv LostWorld Dino DNA
helaas niks te zien dan...
Mr. V 2de jaar BIT
Aantal berichten : 92 Woonplaats : oostende Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 9:46 am
ik zie heel veel op me scherm en dat blasten opzich wal gelukt maar... waar of hoe selecteer ik de gaps?
Lamylar 2de jaar BIT+ admin
Aantal berichten : 143 Leeftijd : 34 Woonplaats : Gistel Registration date : 24-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 9:55 am
Mr. V schreef:
ik zie heel veel op me scherm en dat blasten opzich wal gelukt maar... waar of hoe selecteer ik de gaps?
scroll ebeetje naar beneden zoeken is de hoofdjob van eenbioinformaticus onder die discriptions heb je alignments...
bram 2de jaar BIT
Aantal berichten : 16 Woonplaats : Lendelede Registration date : 30-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 10:53 am
Ook het gevoel daj naar het examen gaat zonder x te weten? xD
Lamylar 2de jaar BIT+ admin
Aantal berichten : 143 Leeftijd : 34 Woonplaats : Gistel Registration date : 24-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 10:55 am
bram schreef:
Ook het gevoel daj naar het examen gaat zonder x te weten? xD
das nie per se slecht, het doet je nadenken tijdens het examen^^ mja khoop dat et goed komt
morf 2de jaar BIT
Aantal berichten : 95 Leeftijd : 35 Woonplaats : Zwevegem Registration date : 26-09-08
Onderwerp: Re: sequentiedatabanken do jan 08, 2009 2:29 pm